こんにちは上領歯科医院の上領哲也です。
　土台を入れてから（？）頭痛がするため、金属アレルギーを心配されているとのことですが、頭痛の原因は他のことから由来しているのではないかと思います。
　が、あまりご心配なら、皮膚科で金属アレルギーのパッチテストを受けてみてください。
　また土台を換えるさい土台に使われている金属の種類や、土台の太さによっては、外す際に歯に負担がかかります。
　場合によっては不可能かもしれません。
　かかりつけの先生にご相談してみてください。